Genbank庫里的數(shù)據(jù)按來源于約55,000個物種,其中56%是人類的基因組序列(所有序列中的34%是人類的EST序列)。每條Genbank數(shù)據(jù)記錄包含了對序列的簡要描述,它的科學(xué)命名,物種分類名稱,參考文獻(xiàn),序列特征表,以及序列本身。序列特征表里包含對序列生物學(xué)特征注釋如:編碼區(qū)、轉(zhuǎn)錄單元、重復(fù)區(qū)域、突變位點或修飾位點等。所有數(shù)據(jù)記錄被劃分在若干個文件里,如細(xì)菌類、病毒類、靈長類、嚙齒類,以及EST數(shù)據(jù)、基因組測序數(shù)據(jù)、大規(guī)模基因組序列數(shù)據(jù)等16類,其中EST數(shù)據(jù)等又被各自分成若干個文件。
Entrez的網(wǎng)址是:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/
BankIt的網(wǎng)址是:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BankIt
Sequin的相關(guān)網(wǎng)址是:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/
DDBJ的網(wǎng)址是:http://www.ddbj.nig.ac.jp/
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目前GDB中有:人類基因組區(qū)域(包括基因、克隆、amplimers PCR 標(biāo)記、斷點breakpoints、細(xì)胞遺傳標(biāo)記cytogenetic markers、易碎位點fragile sites、EST序列、綜合區(qū)域syndromic regions、contigs和重復(fù)序列);人類基因組圖譜(包括細(xì)胞遺傳圖譜、連接圖譜、放射性雜交圖譜、content contig圖譜和綜合圖譜等);人類基因組內(nèi)的變異(包括突變和多態(tài)性,加上等位基因頻率數(shù)據(jù))。GDB數(shù)據(jù)庫以對象模型來保存數(shù)據(jù),提供基于Web的數(shù)據(jù)對象檢索服務(wù),用戶可以搜索各種類型的對象,并以圖形方式觀看基因組圖譜。
GDB的網(wǎng)址是:http://www.gdb.org
GDB的國內(nèi)鏡像是:http://gdb.pku.edu.cn/gdb/